Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Zbed3Q9D0L1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Zbed3Q9D0L1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Zbed3Q9D0L1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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