Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NkapQ9D0F4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NkapQ9D0F4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms