Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndc80Q9D0F1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms