Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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