Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Sgo1Q9CXH7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sgo1Q9CXH7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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