Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Wdr55Q9CX97 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms