Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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