Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BccipQ9CWI3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms