Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rhobtb3Q9CTN4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rhobtb3Q9CTN4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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