Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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