Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pard3bQ9CSB4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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