Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smim8Q9CQQ0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms