Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQM1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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