Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nicn1Q9CQM0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms