Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl35Q9CQL6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl35Q9CQL6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl35Q9CQL6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Mrpl35Q9CQL6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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