Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Znhit3Q9CQK1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znhit3Q9CQK1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms