Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms