Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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