Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms