Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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