Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atoh8Q99NA2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atoh8Q99NA2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms