Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brms1Q99N20 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brms1Q99N20 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms