Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac9Q99N13 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms