Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms