Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms