Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Apobec3Q99J72 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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