Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms