Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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