Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Afg3l1Q920A7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Afg3l1Q920A7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Afg3l1Q920A7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms