Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zcchc18Q8VD24 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zcchc18Q8VD24 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Zcchc18Q8VD24 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms