Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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