Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms