Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpap2Q8VC34 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms