Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SdsQ8VBT2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms