Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OptnQ8K3K8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms