Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms