Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr1eQ8K202 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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