Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sde2Q8K1J5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sde2Q8K1J5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms