Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FgbQ8K0E8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FgbQ8K0E8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FgbQ8K0E8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FgbQ8K0E8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FgbQ8K0E8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FgbQ8K0E8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FgbQ8K0E8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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