Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog3Q8CI04 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog3Q8CI04 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms