Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec10Q8CF98 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Colec10Q8CF98 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Colec10Q8CF98 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Colec10Q8CF98 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Colec10Q8CF98 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Colec10Q8CF98 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Colec10Q8CF98 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms