Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp27Q8CEG8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp27Q8CEG8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms