Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snx30Q8CE50 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx30Q8CE50 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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