Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cacnb2Q8CC27 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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