Protein–RNA interactions for Protein: Q8CA72

Gan, Gigaxonin, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GanQ8CA72 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GanQ8CA72 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GanQ8CA72 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms