Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Atg4aQ8C9S8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Atg4aQ8C9S8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Atg4aQ8C9S8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Atg4aQ8C9S8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Atg4aQ8C9S8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Atg4aQ8C9S8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg4aQ8C9S8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Atg4aQ8C9S8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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