Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Stbd1Q8C7E7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms