Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin9Q8C735 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin9Q8C735 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms