Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp20Q8C6M1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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