Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nlrp4bQ8C6J9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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